要了解海参的内部器官构造，必须将海参解剖。由肛门的背缘开始至触手列的外侧，用剪刀沿背侧将体壁切开，然后把纵切断部的两侧左右分开，边缘用大头针固定于蜡盘上，然后加水将其淹没，以观察其内胜。剌参尽管其外形令人生畏，但其内脏还是绮丽可观。
（1）体壁体切开后即可见到厚的体壁，这是供人们食用的部分，在体壁的内面有5条纵走的肌肉束，3条位于腹壁。各束中央有一狭长的纵沟。
（2）消化系统由口、咽、食管、胃、肠及排泄腔组成。口位于围口膜中央,周围有括约肌，没有咀嚼器。触手将其抓捕黏着的食物送入口中，借括约肌的收缩送入咽部。
咽部为口向下的一段，其周围有1个石灰环,石灰环是由5个白色石灰质的辐片和5个间辐片构成的，咽部下段为食管。
食管下端是富有弹性的胃囊。胃囊下连接着粗细大致均匀的肠管,肠是消化食物和吸收营养的部分。肠管为体长的3倍多，肠靠腹壁的悬肠膜连接悬挂在体腔内。肠道首先在体的右侧直向体的后端，此段称之为第一小肠，然后在左侧，复又折向上方，为第二小肠，最后再在体中央折向下方，称之为大肠，终于肛门，肛门在体的末端。肠壁很薄，肠前部2/3段多为黄色，后段为淡黑色。
肠末端的膨大部分为排泄腔，其周围有许多放射状肌肉连接在体壁。由于辐射肌的伸缩，使排泄腔能排出粪便，并可使海水进、出水肺，以行呼吸和排便作用。
（3）呼吸系统从排泄腔的侧壁向体腔内伸入1条短而粗的薄壁管，再由此分出2枝树枝状的管子，各枝向前端分出多数小分枝盲囊，称之为呼吸树或水肺。呼吸树左侧常较右侧长，左侧呼砠树的细枝与肠管上面的背血管丛（血管网）相密接;右侧的前端盲
囊则不与血管相接,直接进入体腔中。呼吸树除有呼吸作用外还兼有排泄作用。
（4）石灰环石灰环位于食管前端，是一个膨大的不透明的球状环，它包绕着咽部，即各由5个主辐和间辐组成的10个大型的骨板结合成包围咽部的咽球，它支撑并保护着消化管的始端。
